A tó helyes működése érdekében egy jó szűrőrendszer kiépítése elengedhetetlen. Több feladatot látnak el, pl.: nagy mennyiségű levegőt bocsájtanak a vízbe, így elősegítik a megfelelő levegőztetést, valamint kiszűrik a káros anyagokat a vízből. Szűrőrendszer méretét a tó méretéhez kell igazítani.
Szűrőrendszer kiválasztása és elhelyezése nagyon fontos feladat, nem szabad lebecsülni. A megfelelő szűrőrendszer kiválasztása nagyban befolyásolja a szűrés minőségét.